Le professeur Herman Depypere a obtenu son diplôme de docteur en médecine à l'université de Gand en 1986. Il a ensuite obtenu son doctorat biomédical avec la plus haute distinction en 1991. Il a été reconnu comme gynécologue en 1991, après des séjours à l'étranger dans les universités de Rotterdam (Pays-Bas), Adélaïde (Australie), Lille (France), Birmingham (Royaume-Uni). Il a obtenu sa thèse de doctorat en 1994.
Le professeur Depypere est professeur à temps plein à la clinique du sein et de la ménopause de l'hôpital universitaire de Gand. Il a un cabinet privé à la Coupure 4, à Gand.
Le professeur Depypere coordonne une étude avec l'Université de la Sorbonne visant à prévenir la démence par l'administration d'hormones naturelles.